Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD1P0DJD0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms