Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS56P0CW18 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms