Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ROS1P08922 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms