Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFMP07197 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFMP07197 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms