Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFLP07196 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NEFLP07196 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFLP07196 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms