Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms