Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCG5P05408 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCG5P05408 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCG5P05408 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms