Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms