Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D2O95562 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D2O95562 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D2O95562 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms