Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms