Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX4O95219 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms