Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8AO60658 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8AO60658 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms