Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms