Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCEO43556 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCEO43556 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCEO43556 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCEO43556 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCEO43556 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCEO43556 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SGCEO43556 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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SGCEO43556 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCEO43556 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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