Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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