Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms