Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRODHO43272 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRODHO43272 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRODHO43272 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRODHO43272 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms