Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM6AO15550 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms