Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER1O15534 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER1O15534 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER1O15534 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PER1O15534 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PER1O15534 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER1O15534 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER1O15534 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms