Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms