Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM6BO15054 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms