Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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