Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCTN6O00399 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCTN6O00399 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCTN6O00399 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCTN6O00399 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCTN6O00399 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCTN6O00399 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCTN6O00399 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms