Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms