Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms