Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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