Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf98E9PRG8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms