Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms