Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms