Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DXG7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DXG7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B4DXG7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B4DXG7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B4DXG7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DXG7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DXG7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms