Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms