Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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