Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms