Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms