Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms