Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms