Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms