Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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