Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms