Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms