Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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