Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms