Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALKQ9UM73 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKQ9UM73 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms