Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms