Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUCLA2Q9P2R7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLA2Q9P2R7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms