Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms