Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms