Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNKQ9P0W0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNKQ9P0W0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms