Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIS18AQ9NYP9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms