Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTLNQ9NXG0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms